Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC18Q5T9S5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC18Q5T9S5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms