Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUP188Q5SRE5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP188Q5SRE5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms