Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB41Q5JT25 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB41Q5JT25 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms