Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SDK2Q58EX2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms