Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3BQ502W6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VWA3BQ502W6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms