Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN3Q4LDR2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms