Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SWI5Q1ZZU3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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