Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSPP1Q1MSJ5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms