Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABRA6Q16445 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA6Q16445 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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