Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SSX1Q16384 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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SSX1Q16384 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSX1Q16384 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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