Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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