Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALX1Q15699 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
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