Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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