Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NKX1-1Q15270 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NKX1-1Q15270 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
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