Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFTN1Q14699 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFTN1Q14699 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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