Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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IRF3Q14653 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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IRF3Q14653 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF3Q14653 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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IRF3Q14653 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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IRF3Q14653 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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IRF3Q14653 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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IRF3Q14653 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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IRF3Q14653 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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IRF3Q14653 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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IRF3Q14653 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF3Q14653 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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