Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCARF1Q14162 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
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