Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCINQ13939 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCINQ13939 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCINQ13939 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCINQ13939 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCINQ13939 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCINQ13939 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCINQ13939 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCINQ13939 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCINQ13939 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCINQ13939 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCINQ13939 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCINQ13939 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCINQ13939 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCINQ13939 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCINQ13939 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCINQ13939 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCINQ13939 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCINQ13939 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCINQ13939 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCINQ13939 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCINQ13939 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCINQ13939 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCINQ13939 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCINQ13939 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCINQ13939 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCINQ13939 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCINQ13939 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCINQ13939 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCINQ13939 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCINQ13939 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCINQ13939 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCINQ13939 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCINQ13939 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCINQ13939 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCINQ13939 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCINQ13939 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCINQ13939 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCINQ13939 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCINQ13939 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCINQ13939 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCINQ13939 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCINQ13939 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCINQ13939 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCINQ13939 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCINQ13939 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCINQ13939 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCINQ13939 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCINQ13939 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCINQ13939 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCINQ13939 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCINQ13939 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCINQ13939 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCINQ13939 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCINQ13939 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCINQ13939 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCINQ13939 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCINQ13939 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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