Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1DQ13901 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1DQ13901 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1DQ13901 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1DQ13901 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1DQ13901 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1DQ13901 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C1DQ13901 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1DQ13901 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1DQ13901 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1DQ13901 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1DQ13901 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1DQ13901 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1DQ13901 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1DQ13901 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1DQ13901 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
C1DQ13901 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1DQ13901 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
C1DQ13901 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1DQ13901 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C1DQ13901 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
C1DQ13901 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1DQ13901 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1DQ13901 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1DQ13901 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1DQ13901 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1DQ13901 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1DQ13901 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1DQ13901 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1DQ13901 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1DQ13901 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C1DQ13901 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C1DQ13901 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C1DQ13901 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C1DQ13901 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C1DQ13901 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C1DQ13901 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1DQ13901 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1DQ13901 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C1DQ13901 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C1DQ13901 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1DQ13901 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1DQ13901 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1DQ13901 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1DQ13901 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1DQ13901 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1DQ13901 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1DQ13901 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C1DQ13901 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C1DQ13901 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C1DQ13901 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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