Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF2H3Q13889 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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GTF2H3Q13889 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
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GTF2H3Q13889 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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GTF2H3Q13889 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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GTF2H3Q13889 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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GTF2H3Q13889 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GTF2H3Q13889 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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