Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLF9Q13886 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLF9Q13886 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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