Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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TUBA3CQ13748 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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TUBA3CQ13748 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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TUBA3CQ13748 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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TUBA3CQ13748 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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TUBA3CQ13748 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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TUBA3CQ13748 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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