Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALCAMQ13740 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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