Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGADQ13349 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms