Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ATMQ13315 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATMQ13315 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATMQ13315 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATMQ13315 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ATMQ13315 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATMQ13315 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATMQ13315 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATMQ13315 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATMQ13315 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATMQ13315 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATMQ13315 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATMQ13315 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATMQ13315 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATMQ13315 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATMQ13315 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATMQ13315 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATMQ13315 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATMQ13315 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATMQ13315 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATMQ13315 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATMQ13315 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATMQ13315 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATMQ13315 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATMQ13315 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATMQ13315 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATMQ13315 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATMQ13315 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATMQ13315 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATMQ13315 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATMQ13315 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATMQ13315 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATMQ13315 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATMQ13315 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATMQ13315 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATMQ13315 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATMQ13315 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATMQ13315 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATMQ13315 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATMQ13315 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATMQ13315 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATMQ13315 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATMQ13315 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATMQ13315 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATMQ13315 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATMQ13315 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATMQ13315 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATMQ13315 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATMQ13315 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATMQ13315 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATMQ13315 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATMQ13315 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATMQ13315 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATMQ13315 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATMQ13315 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATMQ13315 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATMQ13315 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATMQ13315 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATMQ13315 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATMQ13315 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATMQ13315 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATMQ13315 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATMQ13315 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATMQ13315 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATMQ13315 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATMQ13315 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATMQ13315 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATMQ13315 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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