Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3BQ13214 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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