Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNTN1Q12860 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CNTN1Q12860 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNTN1Q12860 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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