Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NFIAQ12857 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFIAQ12857 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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