Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 STE24YJR117W 1362 nt3.35□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 ERT1YBR239C 1590 nt3.34□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YDR203WYDR203W 318 nt3.34□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.34□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YKL123WYKL123W 381 nt3.34□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 COQ9YLR201C 783 nt3.34□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 RPL33AYPL143W 324 nt3.34□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 YPR050CYPR050C 414 nt3.34□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 RFC5YBR087W 1065 nt3.34□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 VPS38YLR360W 1320 nt3.34□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 SPO14YKR031C 5052 nt3.34□□□□□ -1.87
LSP1Q12230 EMP70YLR083C 2004 nt3.33□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YDR149CYDR149C 708 nt3.33□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 ATC1YDR184C 885 nt3.33□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YDR340WYDR340W 303 nt3.33□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 NKP1YDR383C 717 nt3.33□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 EPT1YHR123W 1176 nt3.33□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 AIM18YHR198C 966 nt3.33□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YLR217WYLR217W 324 nt3.33□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 REC102YLR329W 795 nt3.33□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.33□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.33□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 MIC27YNL100W 705 nt3.33□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 Q0017Q0017 162 nt3.33□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 MSM1YGR171C 1728 nt3.33□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YER158W-AYER158W-A 216 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 DOG1YHR044C 741 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 MRPL49YJL096W 486 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YAR069CYAR069C 294 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 HUB1YNR032C-A 222 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YPR136CYPR136C 513 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 NDT80YHR124W 1884 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 TFC1YBR123C 1950 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 HDA2YDR295C 2025 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 RGC1YPR115W 3252 nt3.32□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 ENP2YGR145W 2124 nt3.31□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 PKP2YGL059W 1476 nt3.31□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 VMA8YEL051W 771 nt3.31□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 AST2YER101C 1293 nt3.31□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 MIG2YGL209W 1149 nt3.31□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt3.31□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 SWD2YKL018W 990 nt3.31□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 TDA8YAL064C-A 381 nt3.31□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YBR063CYBR063C 1215 nt3.31□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 XRN1YGL173C 4587 nt3.31□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 PAM1YDR251W 2493 nt3.31□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 TMA108YIL137C 2841 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 URK1YNR012W 1506 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 GWT1YJL091C 1473 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 SLY41YOR307C 1362 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 PPH3YDR075W 927 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 TVP15YDR100W 432 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 MAM1YER106W 909 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YGR107WYGR107W 450 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YIL174WYIL174W 228 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 EMC2YJR088C 879 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YPT52YKR014C 705 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YKR033CYKR033C 426 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 ERP1YAR002C-A 660 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 SMA2YML066C 1110 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 ERG2YMR202W 669 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YBR090CYBR090C 369 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 RAX2YLR084C 3663 nt3.3□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 RRP42YDL111C 798 nt3.29□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 MRH1YDR033W 963 nt3.29□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 FRQ1YDR373W 573 nt3.29□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YGR115CYGR115C 780 nt3.29□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 MRPL9YGR220C 810 nt3.29□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 RPL14BYHL001W 417 nt3.29□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 CAP1YKL007W 807 nt3.29□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 GTT2YLL060C 702 nt3.29□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 MRPL16YBL038W 699 nt3.29□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 POP7YBR167C 423 nt3.29□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 BPT1YLL015W 4680 nt3.29□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 FLO1YAR050W 4614 nt3.29□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 SNQ2YDR011W 4506 nt3.29□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.28□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 TGL2YDR058C 981 nt3.28□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 UBC13YDR092W 462 nt3.28□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 RGI2YIL057C 495 nt3.28□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 AIM19YIL087C 474 nt3.28□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YJL147CYJL147C 1149 nt3.28□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 YMR087WYMR087W 855 nt3.28□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 HUL5YGL141W 2733 nt3.28□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 REF2YDR195W 1602 nt3.28□□□□□ -1.88
LSP1Q12230 WHI3YNL197C 1986 nt3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.3 ms