Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMOD3Q0VAK6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMOD3Q0VAK6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms