Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RBBP4Q09028 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP4Q09028 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms