Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CYP4F3Q08477 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms