Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLEQ07864 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLEQ07864 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLEQ07864 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLEQ07864 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLEQ07864 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLEQ07864 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLEQ07864 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLEQ07864 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLEQ07864 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLEQ07864 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLEQ07864 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLEQ07864 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLEQ07864 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLEQ07864 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLEQ07864 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLEQ07864 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLEQ07864 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLEQ07864 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLEQ07864 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLEQ07864 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLEQ07864 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLEQ07864 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLEQ07864 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLEQ07864 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLEQ07864 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLEQ07864 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLEQ07864 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLEQ07864 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLEQ07864 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLEQ07864 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLEQ07864 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLEQ07864 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLEQ07864 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLEQ07864 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLEQ07864 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLEQ07864 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLEQ07864 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLEQ07864 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLEQ07864 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLEQ07864 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLEQ07864 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLEQ07864 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLEQ07864 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLEQ07864 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLEQ07864 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLEQ07864 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLEQ07864 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLEQ07864 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLEQ07864 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLEQ07864 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLEQ07864 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLEQ07864 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLEQ07864 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLEQ07864 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLEQ07864 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLEQ07864 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms