Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF11Q05519 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms