Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT17Q04695 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms