Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms