Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BNC1Q01954 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNC1Q01954 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms