Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB1Q01826 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB1Q01826 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms