Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IP78347 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IP78347 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms