Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL11P62913 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL11P62913 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL11P62913 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL11P62913 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL11P62913 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL11P62913 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL11P62913 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL11P62913 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL11P62913 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL11P62913 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL11P62913 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL11P62913 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL11P62913 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL11P62913 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL11P62913 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL11P62913 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL11P62913 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL11P62913 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL11P62913 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL11P62913 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL11P62913 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms