Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR2LP62875 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms