Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CABP4P57796 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CABP4P57796 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CABP4P57796 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CABP4P57796 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CABP4P57796 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CABP4P57796 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CABP4P57796 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CABP4P57796 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CABP4P57796 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CABP4P57796 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CABP4P57796 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CABP4P57796 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CABP4P57796 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CABP4P57796 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CABP4P57796 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABP4P57796 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABP4P57796 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABP4P57796 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABP4P57796 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABP4P57796 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABP4P57796 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABP4P57796 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABP4P57796 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABP4P57796 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABP4P57796 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABP4P57796 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CABP4P57796 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CABP4P57796 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CABP4P57796 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CABP4P57796 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CABP4P57796 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CABP4P57796 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CABP4P57796 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CABP4P57796 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CABP4P57796 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CABP4P57796 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CABP4P57796 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CABP4P57796 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CABP4P57796 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CABP4P57796 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CABP4P57796 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CABP4P57796 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CABP4P57796 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CABP4P57796 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CABP4P57796 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CABP4P57796 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CABP4P57796 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CABP4P57796 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CABP4P57796 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CABP4P57796 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CABP4P57796 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CABP4P57796 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CABP4P57796 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CABP4P57796 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CABP4P57796 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CABP4P57796 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CABP4P57796 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CABP4P57796 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CABP4P57796 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CABP4P57796 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CABP4P57796 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CABP4P57796 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms