Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX10P56693 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX10P56693 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX10P56693 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX10P56693 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX10P56693 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX10P56693 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX10P56693 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX10P56693 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX10P56693 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX10P56693 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX10P56693 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX10P56693 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX10P56693 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX10P56693 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX10P56693 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX10P56693 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX10P56693 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX10P56693 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX10P56693 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX10P56693 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX10P56693 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX10P56693 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX10P56693 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX10P56693 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX10P56693 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX10P56693 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX10P56693 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX10P56693 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX10P56693 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX10P56693 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX10P56693 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX10P56693 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX10P56693 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX10P56693 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX10P56693 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX10P56693 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX10P56693 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX10P56693 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX10P56693 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX10P56693 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX10P56693 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX10P56693 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX10P56693 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX10P56693 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX10P56693 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX10P56693 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms