Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELLP55199 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELLP55199 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ELLP55199 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELLP55199 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELLP55199 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELLP55199 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ELLP55199 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELLP55199 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ELLP55199 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ELLP55199 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms