Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD4P55036 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMD4P55036 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms