Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRLP54845 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRLP54845 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRLP54845 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NRLP54845 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NRLP54845 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRLP54845 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRLP54845 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRLP54845 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRLP54845 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRLP54845 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NRLP54845 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRLP54845 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRLP54845 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRLP54845 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRLP54845 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRLP54845 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NRLP54845 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRLP54845 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRLP54845 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRLP54845 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRLP54845 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRLP54845 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRLP54845 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRLP54845 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRLP54845 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NRLP54845 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRLP54845 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRLP54845 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRLP54845 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRLP54845 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NRLP54845 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRLP54845 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRLP54845 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRLP54845 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRLP54845 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NRLP54845 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRLP54845 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRLP54845 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NRLP54845 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NRLP54845 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRLP54845 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRLP54845 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRLP54845 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRLP54845 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRLP54845 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRLP54845 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRLP54845 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRLP54845 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRLP54845 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NRLP54845 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRLP54845 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRLP54845 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRLP54845 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRLP54845 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRLP54845 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRLP54845 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRLP54845 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRLP54845 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRLP54845 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NRLP54845 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NRLP54845 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRLP54845 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRLP54845 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRLP54845 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRLP54845 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRLP54845 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms