Protein–RNA interactions for Protein: P53044

UFD1, Ubiquitin fusion degradation protein 1, yeastyeast

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFD1P53044 SPT2YER161C 1002 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 MPS2YGL075C 1164 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 YGR039WYGR039W 312 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 YLR198CYLR198C 360 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 MRPL16YBL038W 699 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 AAR2YBL074C 1068 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 YNR062CYNR062C 984 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 YOR203WYOR203W 354 nt2.54□□□□□ -2
UFD1P53044 ART10YLR392C 1557 nt2.53□□□□□ -2
UFD1P53044 MAK11YKL021C 1407 nt2.53□□□□□ -2
UFD1P53044 UBP8YMR223W 1416 nt2.53□□□□□ -2
UFD1P53044 AI3Q0060 1248 nt2.53□□□□□ -2
UFD1P53044 AIM11YER093C-A 414 nt2.53□□□□□ -2
UFD1P53044 YGR111WYGR111W 1203 nt2.53□□□□□ -2
UFD1P53044 CUP1-1YHR053C 186 nt2.53□□□□□ -2
UFD1P53044 CUP1-2YHR055C 186 nt2.53□□□□□ -2
UFD1P53044 PPX1YHR201C 1194 nt2.53□□□□□ -2
UFD1P53044 POL32YJR043C 1053 nt2.53□□□□□ -2
UFD1P53044 NNT1YLR285W 786 nt2.53□□□□□ -2
UFD1P53044 YLR400WYLR400W 474 nt2.53□□□□□ -2
UFD1P53044 YPR027CYPR027C 834 nt2.53□□□□□ -2
UFD1P53044 YBR116CYBR116C 528 nt2.53□□□□□ -2
UFD1P53044 ARO4YBR249C 1113 nt2.53□□□□□ -2
UFD1P53044 GCD2YGR083C 1956 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 MDM1YML104C 3384 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 CDC20YGL116W 1833 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 ERP3YDL018C 678 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YEL010WYEL010W 351 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 VMA5YKL080W 1179 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YLR012CYLR012C 300 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 BET5YML077W 480 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 DIA1YMR316W 1011 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YOL162WYOL162W 648 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 CAT5YOR125C 702 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YPR053CYPR053C 456 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 TIM12YBR091C 330 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 AME1YBR211C 975 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 ICR1ICR1 3199 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 SLS1YLR139C 1932 nt2.52□□□□□ -2.01
UFD1P53044 CAF120YNL278W 3183 nt2.51□□□□□ -2.01
UFD1P53044 PDC2YDR081C 2778 nt2.51□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YDL050CYDL050C 372 nt2.51□□□□□ -2.01
UFD1P53044 FIN1YDR130C 876 nt2.51□□□□□ -2.01
UFD1P53044 BRR6YGL247W 594 nt2.51□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YGR107WYGR107W 450 nt2.51□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.51□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YBL055CYBL055C 1257 nt2.51□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.51□□□□□ -2.01
UFD1P53044 PEX15YOL044W 1152 nt2.51□□□□□ -2.01
UFD1P53044 PPT2YPL148C 522 nt2.51□□□□□ -2.01
UFD1P53044 IRC3YDR332W 2070 nt2.51□□□□□ -2.01
UFD1P53044 BEM4YPL161C 1902 nt2.5□□□□□ -2.01
UFD1P53044 ROG1YGL144C 2058 nt2.5□□□□□ -2.01
UFD1P53044 PPH3YDR075W 927 nt2.5□□□□□ -2.01
UFD1P53044 RPN9YDR427W 1182 nt2.5□□□□□ -2.01
UFD1P53044 RRT13YER066W 558 nt2.5□□□□□ -2.01
UFD1P53044 RGI1YER067W 486 nt2.5□□□□□ -2.01
UFD1P53044 AST2YER101C 1293 nt2.5□□□□□ -2.01
UFD1P53044 SMX2YFL017W-A 234 nt2.5□□□□□ -2.01
UFD1P53044 RPL22BYFL034C-A 369 nt2.5□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YGL117WYGL117W 798 nt2.5□□□□□ -2.01
UFD1P53044 CMC1YKL137W 336 nt2.5□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.5□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YOR385WYOR385W 873 nt2.5□□□□□ -2.01
UFD1P53044 POL30YBR088C 777 nt2.5□□□□□ -2.01
UFD1P53044 DUN1YDL101C 1542 nt2.5□□□□□ -2.01
UFD1P53044 DBP10YDL031W 2988 nt2.5□□□□□ -2.01
UFD1P53044 SLY41YOR307C 1362 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 TLC1TLC1 1301 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 SAD1YFR005C 1347 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YGR067CYGR067C 2415 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 ESC1YMR219W 4977 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 CIN1YOR349W 3045 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 COBQ0105 1158 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 THO1YER063W 657 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 CCE1YKL011C 1062 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YKL222CYKL222C 2118 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 RCE1YMR274C 948 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YNL184CYNL184C 327 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YOR062CYOR062C 807 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 APA1YCL050C 966 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 RED1YLR263W 2484 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 MMS1YPR164W 4224 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YDR239CYDR239C 2364 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 VPS9YML097C 1356 nt2.49□□□□□ -2.01
UFD1P53044 PFF1YBR074W 2931 nt2.48□□□□□ -2.01
UFD1P53044 ILS1YBL076C 3219 nt2.48□□□□□ -2.01
UFD1P53044 ARF1YDL192W 546 nt2.48□□□□□ -2.01
UFD1P53044 MRH1YDR033W 963 nt2.48□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YGL242CYGL242C 546 nt2.48□□□□□ -2.01
UFD1P53044 FSH1YHR049W 732 nt2.48□□□□□ -2.01
UFD1P53044 NNF1YJR112W 606 nt2.48□□□□□ -2.01
UFD1P53044 RPL15AYLR029C 615 nt2.48□□□□□ -2.01
UFD1P53044 NEJ1YLR265C 1029 nt2.48□□□□□ -2.01
UFD1P53044 DCP1YOL149W 696 nt2.48□□□□□ -2.01
UFD1P53044 PET20YPL159C 762 nt2.48□□□□□ -2.01
UFD1P53044 DPB3YBR278W 606 nt2.48□□□□□ -2.01
UFD1P53044 YOR296WYOR296W 3870 nt2.48□□□□□ -2.01
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