Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDST1P52848 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST1P52848 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST1P52848 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST1P52848 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST1P52848 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST1P52848 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST1P52848 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST1P52848 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST1P52848 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST1P52848 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST1P52848 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST1P52848 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDST1P52848 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDST1P52848 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST1P52848 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST1P52848 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST1P52848 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST1P52848 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST1P52848 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST1P52848 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST1P52848 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST1P52848 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST1P52848 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST1P52848 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST1P52848 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST1P52848 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST1P52848 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST1P52848 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST1P52848 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST1P52848 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST1P52848 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST1P52848 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST1P52848 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST1P52848 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST1P52848 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST1P52848 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST1P52848 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST1P52848 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST1P52848 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST1P52848 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST1P52848 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST1P52848 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST1P52848 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST1P52848 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST1P52848 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST1P52848 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST1P52848 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST1P52848 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms