Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB28P51157 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB28P51157 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB28P51157 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB28P51157 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB28P51157 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB28P51157 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB28P51157 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB28P51157 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB28P51157 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB28P51157 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB28P51157 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB28P51157 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB28P51157 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB28P51157 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB28P51157 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB28P51157 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB28P51157 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB28P51157 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB28P51157 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB28P51157 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB28P51157 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB28P51157 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB28P51157 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB28P51157 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB28P51157 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB28P51157 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB28P51157 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB28P51157 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB28P51157 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB28P51157 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB28P51157 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB28P51157 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB28P51157 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB28P51157 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB28P51157 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB28P51157 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms