Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP153P49790 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP153P49790 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP153P49790 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP153P49790 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP153P49790 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP153P49790 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP153P49790 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NUP153P49790 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP153P49790 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP153P49790 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP153P49790 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP153P49790 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP153P49790 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP153P49790 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP153P49790 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP153P49790 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP153P49790 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP153P49790 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP153P49790 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP153P49790 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP153P49790 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP153P49790 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP153P49790 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP153P49790 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP153P49790 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP153P49790 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP153P49790 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NUP153P49790 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NUP153P49790 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NUP153P49790 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NUP153P49790 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NUP153P49790 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NUP153P49790 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NUP153P49790 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NUP153P49790 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NUP153P49790 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NUP153P49790 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NUP153P49790 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NUP153P49790 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NUP153P49790 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NUP153P49790 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NUP153P49790 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NUP153P49790 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NUP153P49790 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP153P49790 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP153P49790 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP153P49790 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP153P49790 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP153P49790 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP153P49790 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP153P49790 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP153P49790 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP153P49790 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP153P49790 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP153P49790 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NUP153P49790 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP153P49790 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP153P49790 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP153P49790 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP153P49790 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP153P49790 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP153P49790 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP153P49790 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP153P49790 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP153P49790 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP153P49790 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP153P49790 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NUP153P49790 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NUP153P49790 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NUP153P49790 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NUP153P49790 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NUP153P49790 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NUP153P49790 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NUP153P49790 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NUP153P49790 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NUP153P49790 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NUP153P49790 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NUP153P49790 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUP153P49790 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUP153P49790 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUP153P49790 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NUP153P49790 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP153P49790 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP153P49790 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP153P49790 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP153P49790 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP153P49790 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP153P49790 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP153P49790 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP153P49790 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP153P49790 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP153P49790 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NUP153P49790 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NUP153P49790 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NUP153P49790 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NUP153P49790 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NUP153P49790 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NUP153P49790 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NUP153P49790 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms